Istnieją dwie dolegliwości, które dają bardzo podobne objawy i polegają na tym samym, jednak stanowią osobne jednostki chorobowe. Są to celiakia oraz alergia na gluten. Gluten to bardzo silny alergen, zwłaszcza dla małych dzieci. W przypadku jednej i drugiej choroby objawy są niemal identyczne.
Objawy chorobowe – bóle brzucha i wzdęcia.
Alergia na gluten łączy się z objawami dotyczącymi zarówno skóry (pokrzywka, krostki na skórze), jak i układu pokarmowego. W przypadku celiakii objawy dotyczą wyłącznie układu pokarmowego. Wspólne dla jednej i drugiej choroby są bóle brzucha oraz wzdęcia, które utrudniają codzienne funkcjonowanie. W przypadku celiakii zmiany są o wiele poważniejsze, gdyż mają mniejsze nasilenie i można je wykryć nawet po kilku latach, w przypadku choroby niemej. Może pojawić się wtedy niedożywienie ciała, spowodowane złym wchłanianiem pożywienia przez kosmki jelitowe. Celiakia jest wykrywana późno, z uwagi na niespecyficzne i często niejednoznaczne objawy. W jednej i drugiej chorobie leczenie jest identyczne – polega na eliminacji glutenu z diety.